Die mit einem Stiftungskapital von fünf Millionen Euro ausgestattete Stiftung schüttet jährlich etwa 300.000 Euro aus. Gefördert werden Projekte in allen neuen Bundesländern, in "besonderen Fällen" auch Initiativen in Westdeutschland. Schwerpunkt ist die Arbeit mit Jugendlichen im Alter zwischen 10 und 15 Jahren. Durch Bildungs- und Erziehungsvorhaben soll das Wertesystem der Jugendlichen gestärkt und Toleranz erlern- und erlebbar gemacht werden.
Die Förderung erfolgt als Voll- oder Teilfinanzierung in Form von Zuschüssen. Die F.C. Flick Stiftung will insbesondere kleinere Initiativen unterstützen.
Einzelne Projekte erhalten in der Regel bis 10.000 Euro. Wenn Projekte es verlangen, kann es auch darüber hinausgehen.